云冈研究院自2019年4月组织研学活动以来，深入挖掘景区文化内涵，依托丰富的文化资源，设计不同的主题线路，根据学员的专业背景和实际需求进行专业化研学课程定制。同时，充分发挥云冈石窟在大同文旅资源中的主导地位，与大同市及周边区县主要文旅单位建立研学合作关系，与国内121家研学机构和美育机构深度合作，按照研学活动的特点及规律进行优化配置，形成条理清晰、主旨鲜明的系列研学课程，近年来设计了以“石窟艺术、北魏文化、建筑艺术、魏碑书法、低碳环保、文物保护、天文地质”为主题的7条文化研学线路。

课程设置以专题讲座、专家解说和体验类手作课三位一体设计研学课程，其中手作课程有云冈造像和瓦当翻制；陶器和瓷器修复；北朝壁画修复和绘制；考古现场体验和木构建筑斗拱模型搭建；洞窟复制新技术考察与体验。

云冈研究院科普基地开展的研学活动受到国家教育部、山西省教育厅的关注和认可，2020年12月7日云冈研究院研学基地被评为山西省第一批“游山西·读历史”研学实践教育示范基地；2021年12月3日被教育部列入中央专项彩票公益金中小学校外研学实践活动基地。2021年12月29日被评为山西省第一批省级文博研学基地。此外，云冈研究院科普基地设置多种形式的文物保护、文物修复、文化宣传的研学科普课程，为开展中小学生科普教育创造了良好条件，2022年3月30日经山西省科技厅评审，云冈研究院被正式评为山西省科普研学基地。