2月，日本学者冈村秀典《云冈石窟遗物篇》由日本京都朋友书店出版。

3月，“十五”期间，山西云冈石窟文物研究所在山西省档案事业建设中，成绩显著，被授予“先进集体”称号。

4月2日～12日，李雪芹、唐贵、韩鹏参加山西省旅游促销团赴日本进行为期10天的旅游促销工作。

4月13日，《云冈石窟》特种邮票首发式暨集邮展览活动在大同市展览馆举行。

4月21日～5月1日，张焯、黄继忠等8人应印度中央考古局邀请赴印度就世界遗产保护工作进行为期11天的考察活动。

5月11日，山西省副省长宋北杉等就世界遗产保护问题在云冈石窟进行专门调研。

5月17日，“首届全国网络媒体山西行”采访活动上百名记者参观云冈石窟。

5月23日，云冈石窟研究院改选工会，张海雁任工会主席，闫宏彬、马丽霞任委员。

5月24日，张焯《云冈石窟编年史》在雁北宾馆举行首发式。该书由文物出版社出版，全书约60余万字，为第一部云冈石窟通史。

5月26日～28日，韩国电视台拍摄《黄河万里行》云冈专辑。

5月下旬，对云冈堡局部（位于石窟西门口处的旧堡）进行加固，原堡墙多次出现塌方，故依照原样进行加固，以保持城堡原状。

是月，中国新闻报在全国范围内评选十处最具人气的旅游景点，云冈石窟名列其中。

6月8日，大同市知名专家及学者就文化遗产保护举办题为“世界遗产——云冈石窟文物保护知识论坛”。

6月10日，云冈石窟前广场举行首个中国文化遗产日纪念活动。大会由副市长冀明德主持，市委书记郭良孝致词。同时宣布大同市第6批国保单位名单。中日友协会长平山郁夫携夫人一行参观云冈石窟并出席首个遗产日纪念活动。

是日，云冈石窟文物研究所被授予“山西省文物保护模范单位”。

6月18日，张焯代表云冈石窟文物研究所参加在河北举行的《北魏冯太后》电视剧开机仪式。

6月23日，赵昆雨等3人赴西藏参加世界遗产大会；黄继忠等2人赴龙门石窟考察石窟保护工作。

6月26日，由中国前外交官联谊会组织的“大使夫人山西行”一行人参观云冈石窟。

7月3日，大同市机构编制委员会以同编发［2006］14号文件通知，“山西云冈石窟文物研究所”更名为“云冈石窟研究院”。

8月18日，云冈石窟研究院挂牌仪式在云冈石窟山门前隆重举行。

8月18日，第七届中国云冈·恒山旅游节开幕，8月28日闭幕。期间云冈石窟共接待游客43000余人。印度《情感之旅》图片展览在云冈石窟西部窟前的文化长廊举行。李治国院长为此长廊题写“博览”二字。印度驻华大使苏里宁先生专程到大同为此展览剪彩。此次展览由印度大使馆与云冈石窟研究院共同主办，共展出图片71幅，集中展示了摄影家本诺伊·K·贝尔镜头中的印度佛教遗迹和佛教艺术。

是月，《2005年云冈国际学术研讨会论文集》由文物出版社正式出版发行。该论文集分为研究卷和保护卷两部分，共收集论文171篇。

8月31日，《爱车》杂志将云冈石窟评为中国最美的地方。

是月，首届云冈石窟集邮展开幕；李雪芹、李立芬《解读云冈》由学苑出版社出版。

9月15日，云冈石窟被评为“中国最具吸引力的地方”。

9月25日，遵照大同市委指示，云冈石窟研究院进行民主测评，推举张焯为院长。

10月21日，大同市委组织部部长刘志杰、副市长冀明德等人代表大同市委宣布任命：张焯任云冈石窟研究院院长兼副书记、黄继忠任书记兼副院长、李立芬任副院长。

10月29日，在北京举办的“2006年中国最令人向往的地方评选”颁奖晚会上，云冈石窟再次入选成为20个景区之一，荣获“中国最令人向往的世界东方石雕艺术之魂金牌称号”。

11月7日，著名作家余秋雨考察云冈石窟，并题词：“北魏雄风犹拂面，万里铁骑归佛山”。

11月20日，云冈石窟研究院召开全院职工大会，就申报五A景区工作做全面动员。

11月24日，大同市政府在云冈石窟召开创建五A景区领导组协调会议，布置申报的有关事宜。

是月，上旬，云冈石窟研究院职工开始积极准备云冈石窟景区申报五A景区材料。同时，云冈石窟研究院职工分二批前往四川、、重庆、武汉、河南等地对有关世界遗产地进行考察学习。

12月，王恒《大同市历史文化丛书·第六辑·云冈石窟》由山西人民出版社出版。